EHPC工业仿真

1EHPC工业仿真 最佳实践 部署架构图 场景描述 本实践适用于使用弹性高性能计算EHPC+ 对象存储OSS运行仿真软件进行模型仿真 的场景中，这里运行的是LAMMPS这款开 源的仿真软件，数据通过OSS上传。 解决问题 1.使用EHPC运行工业仿真软件 2.使用OSS存储数据和代码 3.可视化计算结果 产品列表  弹性高性能计算E-HPC  对象存储OSS  文件存储NAS  云速搭CADT 文档版本：V1.1 发布日期：190724

2云服务器ECS（产品名称） 文档模板（手册名称）/文档版本信息 阿里云 EHPC工业仿真 最佳实践 文档版本：20150122（发布日期） 2

3EHPC工业仿真最佳实践 文档版本信息 文档版本信息 文本信息 属性 内容 文档名称 EHPC工业仿真最佳实践 文档编号 021 文档版本 V1.3 版本日期 2021-08-13 文档状态 对外发布 制作人 敬海 审阅人 文档变更记录 版本编号 日期 作者 审核人 说明 V1.0 2019-02-28 行夜 创建 V1.1 2019-07-24 筱晖 优化 V1.2 2019-12-25 敬海 增加概览页 V1.3 2021-08-13 敬海 增加cadt I

4EHPC工业仿真最佳实践 前言 前言 概述 本文档以一个简单的工业仿真算例，介绍阿里云EHPC工业仿真最佳实践。 名词解释  VPC：专有网络（VirtualPrivateCloud），是用户基于阿里云创建的自定义私有网络, 不 同的专有网络之间二层逻辑隔离，用户可以在自己创建的专有网络内创建和管理云产品实 例，比如ECS、负载均衡、RDS等。  EHPC：弹性高性能计算（，E-HPC）基于阿里云基 础设施，为用户提供一站式公共云HPC服务，主要面向教育科研、企事业单位和个人， 提供快捷、弹性、安全和与阿里云产品互通的技术计算云平台。  SCC：超级计算集群（SuperComputingCluster，简称SCC）在弹性裸金属服务器基础 上，加入高速RDMA互联支持，大幅提升网络性能，提高大规模集群加速比。因此SCC 在提供高带宽、低延迟的优质网络的同时，还具备弹性裸金属服务器的所有优点。  NAS：阿里云文件存储（NetworkAttachedStorage，简称 NAS）是面向阿里云 ECS 实 例、HPC 和Docker 等计算节点的文件存储服务，提供标准的文件访问协议，您无需对 现有应用做任何修改，即可使用具备无限容量及性能扩展、单一命名空间、多共享、高可 靠和高可用等特性的分布式文件系统。  OSS：阿里云对象存储服务（ObjectStorageService，简称OSS），是阿里云提供的海 量、安全、低成本、高可靠的云存储服务。您可以通过调用 API，在任何应用、任何时间、 任何地点上传和下载数据，也可以通过 Web 控制台对数据进行简单的管理。OSS 适合 存放任意类型的文件，适合各种网站、开发企业及开发者使用。按实际容量付费真正使您 专注于核心业务。 III

5EHPC工业仿真最佳实践 前置条件 目录 文档版本信息..................................................................................................................................................................I ......................................................................................................................................................................... 法律声明 II ................................................................................................................................................................................ 前言 III 目录.................................................................................................................................................................................1 ......................................................................................................................................................................... 前置条件 2 资源规划.........................................................................................................................................................................3 ........................................................................................................................................................... 1.搭建基础环境 4 ............................................................................................................................................ 1.1.开通产品及服务 4 1.2.利用CADT构建基础环境...........................................................................................................................5 ................................................................................................................................................................. 2.运行作业 11 2.1.添加用户......................................................................................................................................................11 .............................................................................................................................................. 2.2.创建提交作业 14 .............................................................................................................................. 2.2.1.下载demo文件 14 2.2.2.修改lammps_post.sh文件..........................................................................................................15 ............................................................................... 2.2.3.上传Lammps.zip文件到oss的bucket里 18 2.2.4.登陆EHPC集群，配置ossutil工具...........................................................................................20 .......................................................................................................................................... 2.2.5.提交作业 22 ..................................................................................................................................... 2.3.下载和可视化结果 26 2.3.1.下载计算结果..................................................................................................................................26 ...................................................................................................................................... 2.3.2.可视化结果 26 附录 作业执行输出文件查看....................................................................................................................................29 ...................................................................................................................................................... 文件目录说明 29 ............................................................................................................................................................... 常用API 30 1

6EHPC工业仿真最佳实践 前置条件 前置条件 在进行本实践前，您需要提前开通阿里云账号。 2

7EHPC工业仿真 创建EHPC集群 资源规划  本例使用开源仿真软件LAMMPS，以3dLennard-Jonesmelt模型进行仿真。  地域规划：依据业务实际情况去选择，本例选择华北2（北京）。  按照应用的部署要求做网络规划，本例网络规划如下：  专有网络（VPC）：按照组网用途和习惯自定义命名。 本例规划的CIDR为192.168.0.0/16。  虚拟交换机（VSWITCH）:使用H可用区192.168.0.0/24部署ehpc集群  本例计算量不大，ehpc按照一般集群，登录节点一个，控制节点两个，计算节点两个， 实际使用中可以依据作业计算量弹性增加计算节点数量。 3

8EHPC工业仿真 创建EHPC集群 1.搭建基础环境 本章介绍如何开通产品及服务，并利用云速搭cadt快速部署整个demo系统。 1.1.开通产品及服务 步骤1 登录阿里云官网（www.aliyun.com），单击右上角的控制台。 步骤2 单击左上角的图标。 步骤3 在弹出的页面中，输入产品名称，如ECS，单击对应的链接。 4